因受非典影响分别于今年4月9日和5月19日暂停直航的马祖—马尾、金门—厦门航线，经福建省台办与金门马祖有关人士进行沟通后达成共识，并于日前正式恢复。“两马”、“两门”直航符合台湾民众利益，并将给两岸经贸交流重新带来生机。

近在咫尺的金门与厦门、马祖与马尾，历史上同属福建省管辖，自1949年被一道海峡蕃篱隔绝以后，成了咫尺天涯。2001年1月2日，金门、马祖分别与厦门、马尾实现了直航。福建省为了方便金门、马乡亲回祖地探亲、旅游观光及经商，热情地给予接待。同年1月28日和3月2日，马祖与马尾、金门与厦门签订了有关协议，此后，“两马”和“两门”往来热络。福建沿海的厦门、泉州、南安、晋江及福州，各种食品、生活用品和建材产品等多次应邀赴金门展销，大受欢迎。福州地区与马祖、闽南地区与金门的各种经贸、文化、宗教交流出现勃勃生机。

通过直航往来，金马地区民众增加了对祖国大陆的了解，许多金门、马祖同胞纷纷到厦门和福州购置房产。然而，由于受非典影响，4月9日和5月19日，应金门、马祖方面要求，福建沿海与金门、马祖的海上客货直航暂停。自世界卫生组织相继宣布两岸从疫区中除名后，金马民众和在闽台商强烈希望尽快恢复福建沿海与金马的海上客货直航。福建方面认为，尽快恢福建沿海与金马地区海上客货直航，符合金马民众和台胞利益，并与金马有关人士达成了尽快恢复直航的共识。

7月16日，闽南漳州轮船公司所属“文龙”号货轮，运载着金门急需的河沙1600吨从漳州招银港直航金门，这是两岸非典疫情得到控制后的第一艘海上货运直航船舶。继而福州的“宝昌”号，厦门、泉州的“泉丰169”号货轮也将陆续运载金马地区急需的建材、高梁、家俱等货物分别启运金门和马祖。7月17日，金门县旅游协会理事长杨应雄和金门航运业者、大陆新娘共15人，乘坐金门县“太武”号客轮从金门直航厦门。这也是非典过后“两门”之间直航的第一船。7月22日，马祖方面也有一批游客通过海上直航抵达马尾。