2012年是“两马”航线开通以来的第十二个春运。福建交通集团所属福州港务集团下属福州港客运站从提高客运服务效率，提升服务管理水平，改善客运通关环境等方面，提前做好各项准备工作，确保台胞出行安全，保证春运工作“安全、优质、有序”。
一是实行电子检票，规范旅客信息管理。自1月1日起，正式实行电子检票业务，改变以往人工检票方式为红外线扫描，出港旅客使用统一电子登轮卡检票通关，以规范旅客信息管理，确保联检等各单位实时了解进出港旅客情况，合理安排联检通关工作。
二是开展隐患排查，确保客运安全有序。对候船厅、联检厅、客运码头等旅客密集场所开展隐患排查工作，对排查出的安全隐患明确责任人及具体整改措施，并限期整改；全面检修维护x光机等客运设备，确保安检工作正常顺利进行。
三是丰富服务手段，提升旅客满意度。开放游客服务中心，为往来旅客提供旅游宣传、咨询、投诉和报名等综合服务；与闽运凤凰车队合作，开通市区专线大巴，为旅客提供多种中转服务；组织“青年志愿者”和“为您服务队”加入到服务队伍中，为旅客提供义务服务，保障高峰期服务质量。
